核酸提取中蛋白酶k的作用下载_蛋白酶k裂解细胞(2024年11月测评)
RNA提取常见问题及解决方法详解 RNA提取过程中,可能会遇到多种异常情况,如蛋白污染、DNA污染和RNA降解等。以下是一些常见问题的详细分析及其解决方法: 问题1:RNA上样孔有荧光(蛋白污染) 解决方法: 使用蛋白酶K处理。 重新用氯仿和异丙醇等抽提一遍。 采用磁珠纯化:用2.2X的RNA磁珠纯化回收,并用80%乙醇漂洗。 젧で 纯化详细操作步骤: 准备工作:将RNA磁珠从冰箱取出,室温平衡至少30分钟。配制80%乙醇。 涡旋振荡或充分颠倒磁珠,确保充分混匀。 将RNA样本用dd水补充到50体系,吸取110(2.2X,磁珠:RNA=2.2:1)至RNA溶液中,涡旋或吹打混匀,室温孵育5分钟。 短暂离心并置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约5分钟),小心移除上清。 保持PCR管始终置于磁力架中,加入200新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30秒后,小心移除上清。 重复步骤5,总计漂洗两次。 保持PCR管始终置于磁力架中,开盖空气干燥磁珠至刚刚出现龟裂(不超过5分钟)。 将PCR管从磁力架中取出,加入适量ddH2O,涡旋振荡或使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置5分钟,取上清,即为纯化后的RNA溶液。 问题2:RNA中有DNA污染 原因:部分样本富含蛋白、多糖等,裂解过程中这些物质和核酸一起被释放,核酸易被这些粘稠的物质包裹,导致DNA污染。从某些组织(例如,脾、肾、胸腺)和或转染后的细胞中提取的RNA同样会倾向于存在更高水平的DNA污染。 解决方法: 选用DNA酶对样品进行DNA消化处理。 之后再用磁珠或吸附柱将引入的DNA酶进行纯化去除。 如果后续是做qPCR实验,逆转录的产品选择带有gDNA去除的逆转录试剂盒,则不需要额外处理。 详细操作方法: DNase发挥作用依赖部分离子浓度。DNase在缓冲液中含有Mg2+与Ca2+且不含其他盐的情况下具有最高活性。当标准反应缓冲液成分的盐(NaCl或KCl)浓度从0增加到30mM时,DNase1的活性会降低2倍多。DNase(低于10pg/ml)可以用来降低或者消除RNA样本中DNA的污染,但过高的浓度会影响后续的RT-PCR。一次DNase反应所能处理的RNA量取决于DNA污染的程度。用DNase去除DNA后,后续可用RNA提取柱式法自带的洗涤液洗涤样本,或者采用前述去蛋白的磁珠纯化的方式用2.2X的RNA磁珠纯化回收,用80%乙醇漂洗,即可得到较高纯度的RNA。 问题3:RNA降解 原因:RNA提取保存过程中,很容易出现RNA片段的降解,尤其是针对一些RNA酶活性很强的组织,如胰腺组织、淋巴细胞、肿瘤组织等,本身代谢就比较活跃,如果取样不够及时,RNA容易出现不同程度的降解。 解决方法: 避免高温和辐射,避免操作过于剧烈。 防止产生氧化反应和不适宜的pH值。 用蛋白酶K或者RNaseA消化RNase,注意防止微生物污染等。 通过以上方法,可以有效解决RNA提取过程中的常见问题,获得高质量的RNA样本。
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